Protos ha querido contar en Rueda con unas instalaciones propias y con unos métodos acordes con su estilo, dirigido todo por el experimentado enólogo Carlos Guzmán. En 2006, para elaborar su primera añada, se necesitaron 450.000 kilos de uva y en el 2007 se llegó a los 700.000 kilos. El objetivo es llegar a procesar un millón de kilos de uva, para lo que se ha adquirido una parcela de 4 ha que permitirá futuras ampliaciones de la bodega en los próximos años.

La nueva bodega, de estilo castellano tradicional, cuenta con depósitos de acero inoxidable con capacidad para tratar un millón de kilos de uva, embotelladora, zona para fermentación en barricas, área administrativa, maquinaria e incluso depuradora para cumplir con la normativa actual.

El verdejo 100% que se elabora en La Seca se comercializa con la marca Protos, este aspecto obliga a la bodega a seguir manteniendo su alto nivel de exigencia en la elaboración de sus vinos.